Важно также отметить, что одним из важнейших аспектов реализации бюджетной политики является формирование и финансирование адресных инвестиционных целевых федеральных программ. Так, расширена сфера применения и повышено качество программно-целевых методов за счет модернизации методологии разработки и реализации федеральных целевых программ и подготовки механизма использования в бюджетном процессе ведомственных целевых программ. Оптимизирована структура федеральных целевых программ и подпрограмм, многие программы сокращены, что в итоге позволило сконцентрировать выделяемые средства на решении приоритетных задач.

В настоящее время реализация федеральных целевых программ направлена в основном на развитие производственной и социальной инфраструктуры, активизацию инструментов стимулирования инвестиционной и инновационной активности, поддержку субъектов Российской Федерации, обеспечение внутренней и внешней безопасности.

В тоже время, несмотря на достигнутые результаты и обозначенные приоритеты, федеральные целевые программы, ФАИП как инструмент реализации государственной социально-экономической политики все еще остаются не достаточно эффективными, и имеют серьезные изъяны.

Таким образом, проводимая в настоящее время бюджетная политика соответствует направлениям, заданным Президентом в бюджетном послании «О бюджетной политике в 2007 году» и направлена на обеспечение сбалансированности бюджетной системы в долгосрочном периоде, повышение результативности бюджетных расходов, повышение прозрачности и эффективности государственных и муниципальных нужд, повышение роли среднесрочного финансового планирования и дальнейшее расширение самостоятельности и ответственности главных распорядителей бюджетных средств.